18世纪以来英国一直企图夺取埃及作为英国向阿拉伯各国和非洲大陆扩张的基地，而从一八三三年土埃和约后强盛起来的埃及显然成为英国扩张计划实施的障碍。此外穆罕默德·阿里拒绝在埃及屡行一八三八年英土商务协定，这更使英国恼羞成怒。英国决心挑起土埃再次冲突，以便乘机从中渔利。于是英国便怂恿土耳其苏丹向埃及复仇。一八三九年四月，土军渡过幼发拉底河，向叙利亚推进，六月埃军进行反攻，在尼西布战役中歼灭土军主力，埃军再度进入土耳其本土。七月四日土耳其海军投降，君士坦丁堡再次受到威胁。这时西方列强又出面干预。一八四年七月英国、俄国、普鲁士和奥地利签订伦敦条约，约定以武力援助土耳其。该年九月英奥联合舰队封锁叙利亚海岸，不久受挫的埃军撤出红海东岸地区。该年十一月英国军舰进逼埃及亚历山大里亚港口，穆罕默德·阿里被迫和英国签订英埃协定，承认土耳其主权，定期纳贡、缩减军队，接受一八三八年英土商务协定，同时保留埃及和苏丹的世袭领主权。
两次土埃战争严重削弱了奥斯曼土耳其帝国，引起帝国内外局势的日趋恶化，其半殖民地地位日益加深。同时穆罕默德·阿里创建埃及大帝国的计划也因欧洲列强的干预而破灭，埃及开始沦为欧洲列强的殖民地。